Anacondaでpython3にしたらibus-setupがpythonのエラーを吐いて実行できなくなり、日本語入力ができなくなった。メニューバーのinput methodから行ってもpreferencesが起動せず。

/usr/bin/ibus-setup

の中にあるexec python→exec /usr/bin/pythonと変更したら解決した。